香腸加工成套設備的清潔作業區域包括：香腸、火腿冷加工區、冷卻區、待包裝儲存區以及內包裝區。
1.首先，要確保食品廠作業區內工具的清潔與衛生，并特別關注一些衛生死角的嚴格清理與保持（每兩周進行一次深度清潔）。這些衛生死角包括操作方案的背面、天花板、墻壁以及制冷風機等。在清理衛生后，需對所有墻壁、天棚、設備、器具和案面表面使用過氧化氫銀離子劑進行兩遍以上的消毒擦洗。
2.食品廠車間的凈化工作中，控制霉菌的措施首先要調節車間內的溫度和濕度。理想的溫度應低于24度，濕度則要控制在55%以下，因為過高的溫度和濕度會促進霉菌的繁殖。
3.每天在班前和班后，需要使用5%的過氧化氫銀離子消毒劑對車間內的墻壁、結構、下水道、案面、手部、圍裙和套袖、預冷庫及庫門、速凍庫門、包裝室以及工器具消毒間進行噴灑消毒。在班期間，每2小時也要對墻壁、下水道等進行5%的過氧化氫銀離子消毒劑-奧克泰士噴灑，以殺滅霉菌。
4.工作人員的工作服和更衣室等必須保持清潔衛生，定期進行清洗和消毒，消毒時間需超過30分鐘，以防止霉菌交叉感染。
5.確保食品廠凈化車間的正常運作，保證車間內部空氣符合標準。空調的換氣效果直接影響霉菌的生成。如果車間能及時排出含有大量水分的空氣，就能有效降低霉菌滋生的風險。
由于霉菌產生抗性并能夠通過空氣傳播，因此所使用的消毒產品必須具備消滅霉菌的能力，同時還能用于空氣消毒。